3D掃描儀
挑戰:對幾百塊袋狼骨骼、頭骨、骨架的尺寸進行精準3D數字采集,它們是全球各地博物館保存完整的袋狼剝制模型,并利用這些數據精準測算滅絕物種的體重范圍。
解決方案:Artec Space Spider、Artec Leo、Artec Studio、ZBrush
效果:掃描完幾百塊袋狼標本的高清3D掃描后,科研團隊一塊塊測量了每塊標本,并將完整的袋狼骨架3D掃描數字雕刻成逼真的袋狼3D模型,用于進行數字稱重。研究人員最終準確算出了袋狼體重范圍,發現和以往的測算差距很大。
幾百萬年的進化使袋狼成為野外生存專家。袋狼是自然界中最大的食肉性有袋動物,在進化過程中為自己開辟了一塊專門的棲息地。但很快,一批殖民者出現了。
主要研究員Douglass Rovinsky使用Artec Space Spider在維多利亞女王博物館和藝術館掃描袋狼頭骨
幾十年后,從1830年代早期開始一直到20世紀,幾千頭袋狼,也稱塔斯馬尼亞虎,被農民和獵人大規模獵殺,直到只剩最后一只。
它在野外被捕后關在動物園,度過了生命的最后三年。之后,在某個冬日上午,塔斯馬尼亞所知的最后一只袋狼本杰明,因意外被關獸舍外過夜而死亡。事情發生在1936年9月。而袋狼死亡的59天前,塔斯馬尼亞剛剛為袋狼授予保護動物的地位。
研究員、數字藝術家Damir Martin為袋狼制作的數字形象
最后一只袋狼離世前的許多年,一直流傳著有關袋狼的千奇百怪的傳說,人們認為它們兇猛殘酷,生存能力強,擁有如北歐神話中狂戰士般的頑強體力,能抵御槍林彈雨,甚至還能耗干獵物身上的血液等等。
與此同時,在袋狼還未滅絕,還漫步于塔斯馬尼亞土地上時,科學家未能真正對它們展開研究。直到今天,本杰明離開后不到100年,盡管世人對袋狼更為關注,但還有很多科學家無法解釋的真相和細節。
Damir Martin創作的一對袋狼數字形象
像袋狼的飲食、交配、捕獵、移動習慣、生活習性,甚至體重,我們都不知道。而袋狼的體重是深入研究其他方面的基礎信息。這就涉及到了基礎化學和生理學知識。
袋狼燃燒多少能量?它們儲存熱量嗎?消化食物的速度多快?多久進一次食?它們捕獵哪種動物?自然界中繁殖能力如何?要完全解答這些問題,我們首先要知道袋狼的體重。
各學科之間總是相互依存,也就是說,除非我們徹底搞明白了“概念A”,才會停止對它的誤解,同時解決有賴于“概念A”的其他相關概念。
Damir Martin制作的一對袋狼數字形象
在研究袋狼的幾十年里,多位科學家多次指出缺乏準確體重估算的問題。但之后,并沒人解決這個問題,導致很多人都基于25-29公斤的錯誤估計值進行研究。而且這個估算沒有得到證實。
袋狼研究中另一個需要解決的重要問題就是袋狼是否違背“食肉動物能量消耗”(The costs of carnivory)定律。該定律規定了動物能量分配閾值,14公斤或以下的食肉動物一般會以比自己體形小的獵物為食。
但如果食肉動物體重高達21公斤或以上,如狼和美洲豹,通常會以體型和自己相當或更大的獵物為食。對于體重為14-21公斤的食肉動物而言,比如狐貍和野貓,通常以小型動物為食,但偶爾也會獵食稍大的動物。
Damir Martin制作的袋狼數字形象
不了解袋狼的真實體重,那么這個問題,包括其他一些難題,都無法得到科學可靠的解釋。
莫納什大學PhD學生Douglass Rovinsky和包括Justin W. Adams博士在內的四人研究團隊意識到這一問題的迫切性,開始著手解決。
這一項目的細節發表在Royal Society Proceedings B科學雜志的《Did the thylacine violate the costs of carnivory? Body mass and sexual dimorphism of an iconic Australian marsupial》一文中。
Rovinsky評價了項目的重要性,“像其他滅絕物種一樣,對袋狼了解的越多,就越能幫助我們了解現有物種,了解它們是如何應對環境變化的,目前,世界各地的自然界環境都在發生急速改變。”
這項研究需要他們前往世界各地,在史密森學會等東西方博物館和研究院內,對現存袋狼標本開展研究。
Rovinsky及其團隊很早就意識到,單純依賴傳統的體重估算方式,即通過測量袋狼牙齒進行線性回歸,這種方式對滅絕動物而言通常錯誤率較高。
為提高準確率,最好有一只和袋狼高度相似的活物。袋狼關系最近的近親是袋食蟻獸,約1磅(0.5公斤)重,身材小巧,身披軟毛,以白蟻為食。這樣即可對兩者進行等比例縮放。
Rovinsky及其團隊決定同時使用多種體重測算方法,包括:牙齒和上臂/大腿骨的線性回歸,圍繞袋狼骨骼3D模型制作凸包,之后根據數碼掃描雕刻栩栩如生的袋狼形象,最后,對掃描后的模型以及雕刻后的袋狼模型(和凸包一樣根據骨架掃描模型制成)進行數字稱重。
上排從左往右:Artec Leo掃描的袋狼骨架和用于數字稱重的骨骼凸包體模型
下排:雕刻后的3D袋狼體模型(帶紋理與不帶紋理版),用于數字稱重
為順利完成這項大工程,在多相全譜分析前,他們需要為幾百件袋狼模型進行3D掃描,并制成高精度3D模型,以便采集絕對準確的測量值。
組織安排是Rovinsky及其團隊所面臨的一大挑戰:所有標本來自全球18家不同的博物館和研究所,包括墨爾本本地博物館、澳大利亞和塔斯馬尼亞的幾家博物館,以及美國、歐洲、英國的幾家博物館。
為方便在這些旅途中完成袋狼標本的數字采集并用于體重分析,Rovinsky和Adams使用了一款精度達亞毫米級的輕質手持式3D掃描儀Artec Space Spider。兩位研究員分頭前往不同博物館和研究所,完成了幾百件標本的掃描:骨骼、頭骨、骨架、剝制袋狼標本、保存完整的袋狼標本。
Justin W. Adams博士在瑞典自然歷史 博物館用Artec Space Spider掃描保存完整的母袋狼標本
項目啟動前,Rovinsky和Adams決定不采用卡尺等傳統測量方式,也不采用GDI和攝影測量法這些現代方式。訪問每家博物館的時間極為有限,而且操作過度也會為標本帶來不必要的傷害。
以往的方式非常耗時,還得每天麻煩博物館工作人員看上幾個小時。但結果又不盡如人意,和Artec Space Spider 3D掃描的效果相去甚遠。
傳統方式的弊端在于,操作人員需要在測量過程中反復擺放標本。但有了Artec Space Spider,數據捕獲準確度高達0.5毫米,比其他方式快了幾十倍,而且操作步驟也可忽略不計。
Justin W. Adams博士在瑞典自然歷史博物館用Artec Space Spider以亞毫米級精度對母袋狼標本進行3D采集
和以往經歷相比,Rovinsky說,博物館工作人員發現掃描時間很短,而且對標本風險極低后,簡直“喜出望外”,因為只要幾分鐘,不會影響他們的正常工作。不過,即使掃描很快,博物館館長和其他工作人員也會出于好奇,選擇留下旁觀Space Spider的掃描過程。
“看到Space Spider操作起來如此迅速簡單,他們都十分驚訝。和其他不使用Space Spider的研究人員不同,我們對環境要求不高。不用很大的場地,不用控制光線,也不需要占用他們太多時間,” Rovinsky說道。
Rovinsky還提到,博物館工作人員在見到Space Spider之前就被震驚了,“工作人員說,這里有12件標本,我們會說,接下來12小時就能搞定,什么時候再給12件?只能說他們總覺得數據采集要很久。”
Rovinsky在用Space Spider采集動物標本時,也不斷優化工藝。掃描簡單物體時,比如狼或袋狼的前肢骨骼,他說,“這個處理起來相對快捷輕松,每件標本只要幾分鐘。通常每件標本我掃三次。把標本放在小型便攜旋轉臺上,然后掃描幾圈。每次掃描大概采集400幀左右。然后把標本翻一面,重復一遍。”
主要研究員Douglass Rovinsky在維多利亞女王博物館和美術館用Artec Space Spider掃描袋狼
掃描頭骨時,有些標本很簡單,但有些就很難捕獲完整。“尤其是大型頭骨,可能要9份掃描才能采集完整。這種標本的難點在于頭骨內側的掃描,這些部位很難觸及,通常需要多次掃描,才能完整捕獲頜骨、顴骨、眼眶等部位,”Rovinsky說道。
Rovinsky一般都是離開博物館后進行Artec Studio掃描處理的,“所有編輯融合工作都是之后進行的。我已經養成習慣了,盡可能不打擾博物館人員。所以,到館掃描,掃完離開。所有掃描處理都是事后進行的。”
他繼續補充道,“我只要帶上Space Spider就行,一整個下午,我能完成20-30份標本掃描。所以,出差收集一次數據,過幾個禮拜,我就能帶回幾百份清晰準確的標本掃描,細節豐富,足以完成工作。”
Rovinsky介紹了Artec Studio的處理流程:“首先手動對齊掃描,然后進行幾何全局配準。然后進行尖銳融合,根據物體尺寸選擇分辨率。基本上小于狗頭大小的,選0.1,更大的標本選0.2。”
他繼續說道,“然后我開始跑一到兩次平滑算法。然后進行快速網格簡化,精簡到60萬個三角形。最后的60萬個三角形在數量上也足夠了。當然,60萬和150萬個三角形頭骨間存在分辨率差異,但這種差異對古生物學而言是否有意義就另說了。”
項目下一階段,Rovinsky與墨爾本Artec金牌授權經銷商Thinglab 合作,使用Artec Leo完整掃描了塔斯馬尼亞博物館和美術館里的袋狼標本,這是一款搭載內置觸屏的3D掃描儀,100%無線設計。這些掃描采集了博物館幾套袋狼骨架和全身剝制模型。這些數字骨架之后被用來構建凸包,作為數字雕刻的基礎。
Thinglab的Ben Myers在塔斯馬尼亞博物館和美術館用Artec Leo掃描袋狼骨架
Thinglab的3D掃描總監Ben Myers表示,“我們很喜歡Leo,和自己的客戶一樣,我們已經應用于很多項目了。Leo諸多功能也讓Thinglab工作的我們大吃一驚。過去曲面配準的問題不少,但VCSEL光技術大不一樣。”
在塔斯馬尼亞博物館和美術館用Artec Leo掃描制成的袋狼3D模型
他繼續說道,“追蹤功能非常優秀,可以圍繞物體轉動,哪怕物體幾何復雜也無妨,可以輕松捕獲每個曲面。當然,無線設計加上內置顯示屏也使掃描流程變得尤為簡單高效。”
Thinglab的Ben Myers在塔斯馬尼亞博物館和美術館用Artec Leo掃描袋狼剝制標本
項目最后階段,Rovinsky找到團隊成員,數字藝術家Damir Martin。Martin非常善于描繪古世界,很快便開始創作栩栩如生的袋狼3D形象。
值得注意的是,進行本項目前,Martin早已深入研究過袋狼,已經創作了很多以塔斯馬尼亞自然界為背景的袋狼形象,效果不錯。
Martin的創作以骨架和剝制標本的Leo掃描形象為基礎。加上自己對袋狼的深刻認識和Rovinsky、Adam的幫助,他在ZBrush中一步步為每只袋狼的肌肉組織和外貌進行數字雕塑。形象創作完成后,進行數字稱重,這些測量數據會和其他體重估算值一起用于其他研究。
Damir Martin創作的袋狼3D形象,達到解剖學級別準確度
Martin這樣評價自己的工作:“我一直對滅絕動物很感興趣。袋狼在很多方面都很特別,它們的樣子就獨特且神秘。遺憾的是,很多對袋狼的形象修復,從藝術角度而言,沒有表現出這種生物外貌的微妙之處。”
“但事實上,我們依靠一些罕見的照片和錄像,得知了袋狼的真實外形。所以這個極具挑戰性的項目對我來說很有吸引力。”
借助體重估測(由93頭袋狼的207份掃描計算得出),Rovinsky及其團隊斷定公袋狼實際體重約為19公斤(41.9磅),母袋狼為14公斤(30.9磅)。也就是說,公袋狼比母袋狼重30%。
對比過去幾十年來對袋狼體重的錯誤估計,Rovinsky研究團隊得出的公母袋狼體重大概只有過去的55%。所以,很顯然,袋狼沒有違反“食肉動物消耗”定律,它們屬于中型食肉動物,約為14-31公斤(30.9-46.3磅),通常以小型動物為食,偶爾捕殺大型動物。
該項目只是袋狼進化生物學研究的一小部分,不僅包括這項針對袋狼體重的研究,還包括使用全球采集的3D數據樣本,對袋狼飲食結構、運動能力和袋狼生物特征展開調查研究。
Adam談及3D掃描對這類研究的重要性時,他表示:“古生物學家終于開始認識到三維模型可以推算出更準確的體重,哪怕只是在電腦上進行電子測算,我們仍然可以測量物體外形,和以往通過回歸線繪制變量的方式不同。”
“3D科技徹底改變了我們對滅絕動物體型測算的認知。我認為,未來這樣的應用實踐會越來越多。而且Artec Space Spider和Leo操作簡單便捷,可精準捕獲這類數據,其潛力不可低估。”
Rovinsky評價了數據在其中的關鍵作用。“研究的難點在于,我們需要充足的數據才能生成生物體的完整3D形象,而對很多古生物學家而言,這是不可能的。”
“如果只有幾份標本,也沒有完整骨架的話,是無法實現這樣的準確度的。大多數古生物學家甚至沒有一塊完整的骨骼,更不用說完整骨架了。即便如此,我們依然可以使用Artec掃描儀輕松采集我們需要的海量標本數據。”
Rovinsky還談到了本項目的深遠意義,“我們當然希望能盡可能了解袋狼的真實情況,因為畢竟所有數據、觀察結果和我們得出的結論,都是二手的,很遺憾,我們再也接觸不到活生生的袋狼了。”
他繼續補充道,“所有研究數據都要符合我們的觀察結果、理論解釋和測量值等等。這也反應出對袋狼體重的認知有多重要。這一看似微不足道的數值,會影響大量有賴于這一數據的其他研究。”